Çeneleri ilgilendiren anomaliler genellikle (Alt çenenin veya üst çenenin önde olması gibi) kalıtsaldır.
Üst çene darlığının genel nedeni ağızdan solunum yapmaktır. Burun yollarından kaynaklanan herhangi bir nedenden dolayı ya da alışkanlık gereği ağız solunumu yapan kişilerde üst çenede darlık buna bağlı olarak da yan bölgelerde çapraz kapanışlar gözlenir. Çapraz kapanışlar çene ekleminde problem oluşturabilirler. Tedavi, üst çenenin değişik yöntemlerle genişletilmesidir.
Bazen bireyler çene büyüklüğünü ebeveynlerden birinden, diş büyüklüğünü de diğer ebeveynlerden alırlar. Eğer çene büyük diş küçükse dişler aralıklı olur. Eğer dişler büyük çene küçük ise diş diziminde yerdarlığı- çapraşıklık görülür. Sürekli yalancı emzik ya da biberon kullanma, yutkunma esnasında dilin dişler arasına girmesi, kalem silgi ısırma gibi bazı kötü alışkanlıklar da dişlere ters kuvvetler vererek pozisyon değiştirebilirler.
Zamanından çok önce veya çok sonra süt dişi kayıpları, süt dişlerinde görülen yaygın çürükler ya da dişlerinin normal boyutlarına sadık kalınmadan yapılan kötü dolgularda çapraşıklığa sebep olurlar.